Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功正确地绘制出人类肠道的微生态系统目录!

2021-12-27 00:28:46 来源:
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近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的科学研究报告中都,来自欧陆病毒学的实验室等机构的化学家们通过科学研究将生命胃化学物质第一组中都所有已知的菌株基因序列选集成了一个大型的检索,从而就能协助科学研究职员熟悉即使菌株基因和蛋白之间的关联,以及其对生命生活品质的影响。

菌株遍布整个人体内外,其必需产生细胞内来影响MS磨碎、生活品质和对疾病的易感性,其如此普遍以至于人体化学物质第一组成员的数量要对人卵子还要多,包括菌株、孢子和其它化学物质;为了阐释菌株在生命生物学中都所扮演的极其重要女角,化学家们上则会则会在的实验室中都转化并对其培植,随后在对菌株展开DNA脱氧核糖核酸,然而现有很多菌株还无法在的实验室的周围环境中都被培植饲养。

为了获得这些菌株的相关信息,科学研究职员采取了另外一种作法,他们从周围环境中都(比如胃)收集一般而言采样,随后在对整个采样中都的DNA展开脱氧核糖核酸,然后利用计算机作法对来自一般而言采样中都的数千种物种的个体基因序列展开重修,这种作法被称之为裕基因序列学应用,该应用能作为一种替代作法对单个物种的DNA展开转化和脱氧核糖核酸。

学术界Rob Finn坚称,上次包括我们在内的三个独立开发团队重修了在在个胃化学物质第一组基因序列,而最大的缺陷就是这些开发团队所得到的结果有否具可比性,以及有否能将这些结果选集成为一个非常更进一步的清单。现有科学研究职员已经从生命胃中都超过4600种菌株群落中都选集了20万个基因序列和1.7亿个细胞内基因序列,这种新型的检索(统合的生命胃胃基因序列集合和统合的胃胃细胞内录入)揭示了MS胃的巨大丰富性,并为大幅度展开胃化学物质第一组科学研究先驱者了道路。

学术界绘出出的这个巨大的录入是化学物质第一组科学研究的一个里程碑,更大幅度或将能为化学家们获取非常宝贵的资源来科学研究生命胃生态系统中都每一种菌株所扮演的极其重要女角。这项科学研究表明,超过70%被侦测到的菌株从而在的实验室中都被成功培植过,而其在体内的活性仍然未被发现,而这类菌株中都最大的族裔就是Comantemales;学术界坚称,看到Comantemales如此广泛应用真是一个惊喜,这就引人注意了我们的确对胃中都的菌株知之甚少,我借此这个录入能协助机器学习家和病毒学家在更大幅度几年弥补这一知识填补。

该检索/录入收集的所有数据都能在在线资源Mgnify中都获得,其能协助化学家们深入科学研究化学物质的基因序列数据并且与也就是说的检索展开对比;随着多国科学研究开发团队不断发布最初检索,该录入可能扩大到包括其它MS手部的化学物质第一组,比如皮肤或口腔内部等手部。最后学术界坚称,这一录入的选集更大幅度或为化学物质学家和癌症职员获取比较丰富的资源,然而科学研究职员可能在智利、亚洲和非洲等标志性不足的地区发现更多最初菌株物种,现有科学研究职员并不清楚相同成年人中都菌株丰富性的差异和变化情况。

更早说是:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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